GSCALite数据库——分析基因与药物敏感性之间的关系

GSCALite,整合了来自TCGA的癌症基因组学数据、GDSC和CTPR的药物反应数据以及GTEx的正常组织数据,可用来做:表达分析、生存分析、药物敏感性分析、通路相关性分析等。这里着重为大家介绍利用GSCALite数据库进行药物敏感性分析!

使用教程

1. 输入想要研究的基因组(不能少于5个),点击“搜索”,随后选择相应的癌症类型及分析内容,且注意是否存在无效基因,要及时修改(如下图所示),最后点击“Start Gene Set Analysis”进行分析

2. 当出现“Please check the results on top-left menus of TCGA Cancer/Drug Response/GTEx Normal Tissue.”,点击左上方”Drug Sensitivity”,如下图所示

3. 更新页面后,可以分别看到基于某个特定数据库(GDSC或CTRP)下的分析结果

4. 正相关意味着基因高表达对药物具有抗性,反之亦然,保存方式如下图所示

以上就可以得到基因表达与肿瘤抗药性之间的关系啦~~是不是很简单,快去试试吧

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