利用NCBI查询基因的组织表达谱

我们在研究某个基因的功能之前,首先可能想知道这个基因在某组织中有没有表达,或者表达量高还是低。本期就为大家讲解如何利用NCBI查询某个基因的组织表达谱。

1. 打开NCBI官网后,在下拉选项框中选择Gene,在文本框里输入想要查询的基因的名称并带上物种,点击Search。这里我们查询一下EGFR基因在小鼠各组织的表达谱。

 

2. 如下图所示,出现小鼠EGFR基因的一些基本信息,点击Efgr-epidermal growth factor receptor。

 

 

3.小鼠EGFR基因更为详细的介绍就出现了。我们关心的是该基因的组织表达谱,点击Expression那行的See more。

 

 

4. 即出现了该基因在小鼠各个组织的表达情况。同时还提供了转录组测序的数据以及做该研究的那篇文章。

 

 

当然,这也是基于别人测得的转录组数据以及发表的文章才收录的,并不是所有基因在所有物种中的表达谱都能查到。例如,我们用同样的方法查询EGFR基因在奶牛中的组织表达谱,就查不到。本期介绍的在NCBI上查询基因表达谱的方法就暂且作为我们实验开始前的一个参考,具体的表达情况还是要通过具体的实验来说明的。
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