NcRI:实验证实炎症ncRNA

NcRI(http://www.jianglab.cn/ncRI/)是一个人工挖掘炎症性疾病中实验证实的非编码RNA数据库,2020年六月发表在BMC Genomics。
数据库目前包含三个物种:人类、小鼠和大鼠;三个主要的非编码RNA类别:miRNA、lncRNA和其他非编码RNA。在人类中包含的miRNA、lncRNA和other ncRNA分别为1115、1202和82;在小鼠中包含的三种类别数目分别为647、59和26;在大鼠中包含的三种类别数目分别为218、148和0。在人类中包含254种疾病类型,在小鼠中包含115种疾病类型,在大鼠中包含41种疾病类型。
数据库一共分为查询、浏览、下载、提交和帮助5个模块。
查询模块:

在查询模块,用户可以单独输入非编码RNA或者疾病进行查询,也可以同时输入非编码RNA和疾病。这里以miR-155-5p和红斑狼疮为例进行查询。
 

在结果界面,可以得到非编码RNA和疾病的名字、非编码RNA的上下调信息、检测方法、通量信息、PMID和物种信息。用户可以对物种和通量进行筛选,此外还可以点击放大镜查看更多信息。这里以第一行为例。
 

在详细结果界面,用户可以得到包含分子机制在内的更多更详细的信息。
浏览模块:
用户可以通过点击和浏览选择感兴趣的非编码RNA和疾病进行查询。同样可以得到和查询模块一样的结果界面。

下载模块:
用户可以在下载模块下载数据库中包含的所有数据,包括人类数据、小鼠数据和大鼠数据。

提交模块:
如果用户有自己的实验数据,可以选择上传到此数据库,为数据库丰富内容。按照数据库的上传数据格式进行填写,最后点击submit就成功了。

帮助模块:
帮助界面描述的是数据库的详细使用方式。对于每一个模块有详细的描述和解释。

炎症一直被认为是感染性疾病发病、进展和结局的中心因素众所周知,促进肿瘤的炎症(Tumor Promotion Inflammation)是癌症的十大特征之一。在过去数十年中,大量的研究证实了炎症反应和癌症发病机理之间的关系。
非编码RNA,如miRNAs和lncRNAs,已成为控制免疫和炎症过程的重要调控因子,在炎症疾病和免疫治疗中发挥着重要作用。
虽然文章影响因子不高,但是数据中的非编码RNA都是经过实验验证的。这个实验证实的炎症相关非编码RNA数据库,为我们进行疾病和肿瘤免疫分析提供了可靠的数据支持。近几年非编码RNA是申请各种基金的热点,如果对炎性noc-coding RNA感兴趣的可以联系我们的客服小姐姐为您打造个性化方案哦!
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