相关性图

你是否也遇到“将自己的结果与其它研究结果比较”这样的问题,我们看看肺癌领域的大神Charles Swanton是怎样做的?这是2019年发表于Nature的一篇文章,比较了本研究得到的免疫细胞浸润结果与Danaher et al.团队得到的免疫浸润结果的相关性,颜色越红代表相关性系数更强,越蓝代表负相关性越强,黑色的叉号代表两者相关性不显著。

 

当然,这类高级相关图的展示可以有很多种,小编为大家整理如下:

Figure1_Circle. 点的颜色和大小代表相关性强弱。

Figure1_Circle_Addtext.在上图基础上添加相关性系数。

 

Figure2_ellipse.椭圆形的颜色代表相关性强弱,方向代表正负向相关。

 

Figure3_pie. 用饼图代表正负向相关性的强弱。

 

Figure4_heatmap. 常规热图代表相关性强弱。

 

Figure5_Num. 展示出相关性系数,颜色深浅代表相关性强弱。

 

Figure6_upperOrlower. 上三角图。

Figure6_upperOrlowerAddp.上三角图,并显示出p值显著的相关性,不显著的用叉号表示。

 

Figure7_upperOrlower_ColorNum. 组合图,相关性系数(圆点图)+相关性数字的高级组合。

 

Figure8_upperOrlower_BlackNum. 组合图。相关性系数(圆点)+相关性p值(叉号)+相关性数字。

 

Figure9_upperOrlower_PieNum。组合图,相关性饼图+相关性数字组合。

统计与绘图

Perl版Circos-基础篇-图形文件结构和文件格式

2020-8-28 0:37:10

统计与绘图

多维组学通路分析R包ActivePathways的使用方法及Cytoscape绘制网络图的实用教程

2020-8-28 0:44:22

加入Q群
0 条回复 A文章作者 M管理员
    暂无讨论,说说你的看法吧
个人中心
今日签到
有新私信 私信列表
搜索