经过同行评审的视频protocol数据库JoVE

在平时的科研过程中,广泛地阅读文献是获得idea的第一步,而后融合进自己的实验则需要相应的protocol指导。今天这一期在这里先带大家看一个不一样的protocol数据库——同行评审的视频protocol数据库JoVE

JoVE全称Journal of Visualized Experiments (https://www.jove.com/),顾名思义是一个可视化的实验杂志。创建于2006年10月的JoVE是第一个被SCI收录的视频数据库,迄今已经收录了12267个有关实验方法与科学概念的视频条目,且由于经过了同行评审(Editorial & Peer Review),质量也足以信赖。

 

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JoVE和其他数据库有什么不同?

有同学可能会问,JoVE和其他的protocol数据库相比有什么不同呢?我觉得主要有以下几点:

① 每个protocol都附有实拍的实验过程视频——这是JoVE最大的特色:除和其他杂志一样分享实验结果之外,它更注重用视频的形式展现实验的过程,文字描述的protocol里不明白的部分,借助视频可以进一步理解和学习,便于实验过程与结论的复现;

② 除了protocol之外,对于实验的原理及相关背景知识也一并提供,并在JoVE education板块还有分门别类的基础理论系列微课视频,知其然亦知其所以然;

③ 和国内的互助类论坛(丁香通、小木虫等)相比,作为正规SCI期刊的JoVE所刊发的protocol经过了同行评审,更加规范化,踩坑的可能性更小一些,用着更放心。

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JoVE主要有哪些方面的内容?

JoVE的资源包括生物学、化学、遗传学、免疫学、药学、神经科学、肿瘤研究等领域,主要分为Education和Research两大板块:前者偏向于实验原理(理论知识)、经典实验以及临床技能等的可视化讲解,偏向于基础和经典;后者则是按月发行的SCI期刊,可以理解成包含了实验方法学视频的paper,更偏重于新进展一点。下面分别用实例和大家分别介绍一下它们。

 

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Education板块简介

 

Education版块中,包含JoVE Core、 Science EducationLab manual三个板块,分别侧重基本概念、基础知识和经典实验;另外还有一个单独的video mapping to your course板块,供使用对应教材的同学按教材章节编排系统地学习某一课程,包括生物学、临床技能、实验教程等。

举个例子,假设我现在要进行表观修饰方面DNA甲基化相关的检测,便可以到JoVE Science Education Library→Advanced biology→Genetics中观看DNA Methylation Analysis的视频教程,包含了实验原理、步骤、材料、操作视频等方面的资源以供学习。

 

02
Research板块简介

再来看看Research板块,这个相对Education来说更加与时俱进,代表了实时的新进展中的新方法,可能对大家来说实际参考意义更大一点。具体的架构大家可以自己根据需求看一看,一般根据各自的需求检索即可获取相应内容,不再赘述,这里主要和大家推荐一下个人比较喜欢的JoVE journal中的Methods Collection板块( https://www.jove.com/methods-collections)。

Methods Collection板块相当于特刊或者说合集的形式,按照各个专题邀请各个领域的guest editors进行组稿,集中介绍某一主题中的典型实验方法学以及进展,我觉得相对于个人的检索与权衡,专家挑选有些时候可以起到他山之石的事半功倍作用,可以多借鉴借鉴。

例如我最近找过的这个蛋白质相互作用的专题,两位特邀编辑则撰写并拍摄了Editorial对蛋白质相互作用的技术和应用作了评述,选取了数篇文章介绍了免疫共沉淀、亲和纯化、X线晶体衍射、核磁共振波谱(NMR)和微型热泳(MST)等方法及应用的实例。

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 JoVE是免费使用的吗?

补充说明一下,JoVE目前还没有完全采用OA(open access)的出版方式,除部分公开的视频外,其余教程视频、期刊视频都需要获取访问权限后使用。(查询你所在机构是否开通了JOVE资源的链接:https://www.JoVE.com/subscribe/subscribed-institutions  示例图为北京地区开通该数据库的院校列表) 

截至本文完稿为止,大陆地区已有83所高校订阅,这个名单仍在不断扩充当中,学校没有开通的同学,可以向自己所在机构的图书馆提提建议,网络上还有一些其他的用上JOVE的方法,包括B站也有up主搬运翻译了部分视频资源,但还是希望大家都能尽快用上正版JOVE!

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